本研究针对蛋白质网络嵌入在跨物种机器学习中的挑战,开发了SPACE(STRING Proteins as Complementary Embeddings)系统。研究人员通过整合STRING数据库中1,322种真核生物的蛋白质网络和orthology关系,采用node2vec和FedCoder技术生成512维跨物种网络嵌入,并与ProtT5序列嵌入互补。